变形链球菌表面蛋白真核表达载体pcDNA3-PAc的构建
变形链球菌表面蛋白真核表达载体pcDNA3-PAc的构建
Ⅱ.玻璃纤维质粒分离纯化层析柱重复利用有效性的验证摘要 目的:寻找一种成本较低又可获得较高纯度质粒DNA的方法。方法:根据玻璃纤维质粒纯化层析柱分离纯化核酸的原理,对其使用方法进行改进。使一次性使用的玻璃纤维层析柱能够重复使用。利用分光光度法测定12次重复使用获得的质粒DNA浓度和纯度。进一步利用酶切实验、体外连接和转化实验对重复使用玻璃纤维层析柱获取的质粒DNA进行检测。结果:重复使用玻璃纤维层析柱12次获得的质粒DNA在浓度和纯度上均无明显差异(P>0.05),并且均能被内切酶充分酶切,重新连接后能够很好地被转化。结论:重复使用玻璃纤维层析柱分离纯化质粒DNA的方法能制备出大量高纯度的质粒DNA,不影响质粒的酶切、体外连接和转化,大大降低了成本,在分子克隆和基因免疫研究中具有一定意义。
关键词 柱层析法 质粒DNA 分离与纯化
分离纯化质粒DNA的方法较多,各有其优缺点。在转基因动物、真核细胞转染及DNA外切酶删切缺失等实验,对闭合环状双链DNA的要求较高[1]。一般需采用成本较高的氯化铯-溴化乙锭梯度平衡超速离心法或柱层析洗脱法。为了获取基因免疫所需的高纯度质粒DNA,本实验根据玻璃纤维质粒纯化层析柱分离纯化核酸的原理,对层析柱的使用方法进行改进,力图找到一种成本较低又可获取较高纯度质粒DNA的方法。
1 材料和方法
1.1 菌种
E.coli HB101(含质粒 RSV-BL)(华西医科大学微生物学教研室贾文祥教授提供),E.coli XL-1 blue(四川大学生命学院分子生物学实验中心张义正教授提供)。
1.2 试剂
悬浮缓冲液(suspension buffer),裂解缓冲液(lysis buffer),连接缓冲液(binding buffer),清洗缓冲液Ⅰ(wash buffer Ⅰ),清洗缓冲液Ⅱ,Tris/EDTA(TE)缓冲液,TB缓冲液。RNase A,玻璃纤维质粒分离纯化层析柱和收集管,限制性内切酶EcoRI,T4 DNA连接酶和连接缓冲液(以上试剂均购于德国BM公司)。其余试剂为国产分析纯级(AR)产品。
1.3 质粒RSV-BL的分离纯化
参照文献[2,3]和产品说明书按如下步骤进行:①将甘油保存的菌种HB101(含质粒 RSV-BL)接种于3 ml含100 μg/ml氨苄青霉素的Luria-Bertani(LB)培养基中,37℃振荡过夜,取1 ml菌液转种于30 ml含相同抗生素的LB培养基中, 37℃剧烈振荡培养至A600=1.5~2.0;②取1.5 ml菌液分别装入12只Eppendorf(EP)管中(编号1~12)离心(5000 g×5 min),弃上清、控干;③每管加250 μl含0.1 mg/ml(w/v)RNase A的悬浮缓冲液,在振荡器上振荡10~20 s使菌体均匀分布。④每管加250 μl裂解缓冲液,倒置数次混匀,室温下放置4~5 min。⑤每管加350 μl预冷的连接缓冲液,倒置数次混匀,冰浴5 min后离心(13000 g×10 min)。⑥将玻璃纤维质粒分离纯化层析柱与收集管连接好后将1号管内的上清转移至层析管中,离心(13000g×1 min);⑦加500 μl清洗缓冲液Ⅰ,离心(13000g×1 min),700 μl清洗缓冲液Ⅱ,离心(13000g×1 min);⑧将层析管插入干净的EP管中,加100 μl TE缓冲液离心(13000g×1 min),EP管内的液体即为纯化的核酸样品;⑨将2~12号管内上清使用同一个层析柱按步骤⑥⑦⑧重复。每次加样前用TE缓冲液洗柱2次。将所得核酸样品编号1~12号。
1.4 纯度、浓度测定
将各样品在紫外分光光度计上测A260值,计算各管内DNA的量。采用多样本均数间的方差分析(F检验)比较12次重复抽提质粒DNA的浓度差异。测A280值,计算A260/A280比值,判断其纯度。
1.5 酶切分析[5]
每个样品各取2 μl,加16 μl双蒸水,2 μl 10倍酶切缓冲液和2 μl(10 u/μl)的EcoRI内切酶,37℃温育2 h,反应液在65℃温育10 min灭活内切酶终止反应。各取10 μl电泳。照相记录结果。
